Las clases FileInputStream y FileOuputStream permiten leer y escribir archivos mediante streams, trabajando con datos binarios y basándose en objetos de tipo File que representan el archivo de lectura y el archivo de escritura. El código siguiente muestra la estructura básica de lectura y escritura de un archivo con FileInputStream y FileOutputStream mediante un array de bytes.

import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileOutputStream;
public class CopiarArchivo {
 
    public FileInputStream input;
    public FileOutputStream output;
    public byte[] b;
    public File fileInput,fileOutput;
    
    public CopiarArchivo(){
        fileInput= new File("archivo.txt");
        fileOutput = new File("archivo2.txt");
    }
    
    public void duplicar(){
        input = new FileInputStream(fileInput);
        output = new FileOutputStream(fileOutput);

        b = new byte[(int)fileInput.length()];            
        input.read(b);
        output.write(b);
        input.close();
        output.close();
    
    public static void main(String[] argumentos) {
        CopiarArchivo cp = new CopiarArchivo();
        cp.duplicar();
    }
}

Este mismo ejemplo se puede realizar mediante un while y un dato de tipo entero.

import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileOutputStream;
public class CopiarArchivo {
 
    public FileInputStream input;
    public FileOutputStream output;
    public int b;
    public File fileInput,fileOutput;
    
    public CopiarArchivo(){
        fileInput= new File("archivo.txt");
        fileOutput = new File("archivo2.txt");
    }
    
    public void duplicar(){
        input = new FileInputStream(fileInput);
        output = new FileOutputStream(fileOutput);
        while((b=input.read())!=-1)                    
            output.write(b);
        input.close();
        output.close();
    
    public static void main(String[] argumentos) {
        CopiarArchivo cp = new CopiarArchivo();
        cp.duplicar();
    }
}

Para poder compilar estos dos códigos anteriores es necesario encerrarlo todo con try-catch obteniendo un archivo duplicado mediante las clases FileInputStream y FileOutputStream.

import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
public class CopiarArchivo {
 
    public FileInputStream input;
    public FileOutputStream output;
    public byte[] b;
    public File fileInput,fileOutput;
    
    public CopiarArchivo(){
        fileInput= new File("archivo.txt");
        fileOutput = new File("archivo2.txt");
    }
    
    public void duplicar(){
        try {
            input = new FileInputStream(fileInput);
        } catch (FileNotFoundException ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
        try {
            output = new FileOutputStream(fileOutput);
        } catch (FileNotFoundException ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
        b = new byte[(int)fileInput.length()];            
        try {
            input.read(b);
        } catch (IOException ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
        try {
            output.write(b);
        } catch (IOException ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
        try {
            input.close();
        } catch (IOException ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
        try {
            output.close();
        } catch (IOException ex) {
            ex.printStackTrace();
        }
    }
    
    public static void main(String[] argumentos) {
        CopiarArchivo cp = new CopiarArchivo();
        cp.duplicar();
    }
}